Il Santuario di Santa Maria di Siponto di Manfredonia è uno dei monumenti storici più importanti della città.
Questo tempio,se guardato da vicino, risponde alle segnalazioni che ne fa l’espressione di una sontuosa cappella di pietre quadrate.
La campanella situata in alto, venne collocata solamente nel Settecento; più su era possibile vedere anche la testa di un’aquila e sul frontone nel centro, lo stemma dell’arcivescovo Ginnasio. Il resto è davvero un piccolo gioiello appartenente all’arte romanico-pugliese.
All’ingresso del Santuario di Santa Maria di Siponto di Manfredonia spicca il bellissimo portale, che si apre tra due grandi leoni, dal cui dorso spuntano due colonne che reggono le mensole per l’archivolto nel centro; ai lati invece si sviluppano una lunga serie di archi ciechi che una volta ruotavano intorno a tutto il tempio con un bellissimo effetto.
Al centro di essi, ecco i rombi ornamentali che ricordano molto la stretta parentela tra il romanico pisano e quello pugliese.
La zona interna invece è formata da un quadrato, al centro, con  ben quattro piloni; per tre lati, gli archi rispondo sulle arcate esteriori e solamente nella zona orientale la parete fa pensare ad alcune riparazioni compiute prima che venne consacrata la Chiesa.