Chiamato da molti anche Porto Vecchio, il porto di Manfredonia è una importante ed antica
struttura.
Fu molto importante durante il controllo del Regno delle Due Sicilie, al punto che nel corso del XIX secolo venne creato un progetto di collegamento ferroviario con la città di Napoli, per l’imbarco di tutte le merci verso i paesi orientali; però, di questo, venne realizzata solamente la tratta di collegamento verso Foggia.
E’ costituito dal molo a forma di gomito a ponente lungo ben 900 metri, dal molo di levante (925 metri), e dalla centrale banchina di tramontana; è comunque fornito di ogni genere di servizio di assistenza, riparazione e rifornimento per le barche.
Il porto industriale invece è localizzato a 1,8 miglia ed Est Nord Est rispetto all’imboccatura dell’antico porto di Manfredonia. Il golfo della città permette uno strategico punto d’approdo; la prima civiltà che sfruttò questa caratteristica fu quella dei Dauni, che nel corso degli anni intrattennero tanti scambi commerciali con tutte le attività che si affacciavano sul mare Mediterraneo.
Subito dopo furono prima i greci e poi i romani; difatti sono presenti numerosi resti, purtroppo però oggi non visibili, perché situati sotto il livello del mare.