La Chiesa di San Benedetto di Manfredonia si trova esattamente nel centro storico, ed è una delle più belle della città.
Si presenta con una planimetria lineare ed armonica, ricavata dove una volta sorgeva l’antico Palazzo Pretoriano, utilizzato al tempo per l’amministrazione della giustizia.
All’interno, dopo l’invasione dei turchi, si insediarono le suore monache celestine della S.S.Annunziata, visto che avevano perduto il proprio monastero nelle vicinanze del castello; dunque il Palazzo Pretoriano venne trasformato in una chiesa, dove ricavarono al piano terra la sacrestia e a quello superiore i coretti.
L’ingresso è decorato con lesene, pulvini e capitelli, dove si nota una grata sagomata con piccole sbarre di ferro.
L’interno della Chiesa di San Benedetto di Manfredonia è formata da una navata centrale, le pareti laterali sono abbellite da più coppie di lesene, decorate con tanti stucchi di rilievo. Lungo le pareti sono state ricavati ben quattro altari corredati da tre tele ed un bellissimo crocifisso del Settecento; esse raffigurano Santa Lucia, San Benedetto e l’Assunzione, opere ignote di scuola napoletana, mentre le tele firmate sono quelle presenti nella parte laterale del presbiterio, che raffigurano la Santa Famiglia e l’Annunciazione, a cura di F.S.Serio.